Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFA2T2O43439 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms