Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms