Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms