Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms