Protein–RNA interactions for Protein: O14818

PSMA7, Proteasome subunit alpha type-7, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA7O14818 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA7O14818 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms