Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F3O00716 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F3O00716 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F3O00716 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F3O00716 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F3O00716 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms