Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms