Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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