Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LINC00587B1AMM8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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