Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms