Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF316A6NFI3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF316A6NFI3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF316A6NFI3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF316A6NFI3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF316A6NFI3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms