Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC162PA2VCL2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms