Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND3A2RUS2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND3A2RUS2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms