Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
A0A0U1RRA0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A0A0U1RRA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms