Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YYE9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YYE9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms