Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIAS3Q9Y6X2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIAS3Q9Y6X2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms