Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms