Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C5Q9Y5Q8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms