Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms