Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF330Q9Y3S2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF330Q9Y3S2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms