Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COQ4Q9Y3A0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ4Q9Y3A0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ4Q9Y3A0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms