Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL20Q9Y2M5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms