Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.8■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC49.75■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC49.75■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC49.75■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC49.75■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC49.74■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC49.69■■■■■ 5.55
NISCHQ9Y2I1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC49.69■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC49.69■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC49.68■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC49.66■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC49.64■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
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