Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms