Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms