Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP17Q9ULZ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP17Q9ULZ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms