Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms