Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms