Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms