Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPUSD1Q9UJJ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms