Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms