Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VTI1BQ9UEU0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VTI1BQ9UEU0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms