Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP2Q9UDT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms