Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms