Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP35Q9P2H5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms