Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARCH4Q9P2E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARCH4Q9P2E8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms