Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNKQ9P0W0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms