Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXXC1Q9P0U4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms