Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CWC15Q9P013 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC15Q9P013 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms