Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZA1

CLIC5, Chloride intracellular channel protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC5Q9NZA1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC5Q9NZA1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC5Q9NZA1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms