Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5S1Q9NUS5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms