Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms