Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TM7SF3Q9NS93 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms