Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms