Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB9BQ9NP90 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB9BQ9NP90 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms