Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PREBQ9HCU5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms