Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms