Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms