Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms