Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELL3Q9HB65 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms